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“基因组技术的资料分析”专题介绍

Published at: 2015年第1卷第S1期

蔡孟勳 1
1 国立台湾大学生物科技研究所
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【编者按】科研时间平台已经上线:http://kysj.amegroups.com/。科研时间,是以一个个专题为中心的“中文期刊”;也是以一个个专题为中心的“中文专著”;科研时间,是一个平等、开放的学术平台,在这个平台上,作者、审稿人、读者与编辑能够平等交流,畅所欲言,相互协作;科研时间,也是一个帮助中青年学者成长的舞台,在这个舞台上,只要您有才华,只要您愿意分享,您就能够获得阵阵掌声……科研时间平台,我们采用邀请注册制,从现在起,发送您的简历到kysj@amepc.org,通过委员会资格审核,就能被邀请成为科研时间网站的注册会员。本期是科研时间网站专题之一:《基因组技术的资料分析》,该专题的一系列精彩视频讲座等着您,期待您的加入!

基因组技术的资料分析 Data analysis for high throughput genomic technology

生物科技突飞猛进,有许多高通量平台陆续被大家广泛应用在各个不同的生物或生物医学领域中。我们准备了一系列不同课程来介绍包含这个微阵列(Microarray)和次世代定序(Next Generation Sequencing; NGS)相关的议题,希望通过这些议题的介绍,让大家能更熟悉这些高通量平台的技术及原理。

课程包括以下三个部分,

第一个部分:微阵列芯片(Microarray)

从介绍什么是微阵列芯片开始,接着介绍微阵列芯片的资料如何进行基因表现差异分析,以及利用微阵列芯片来进行对甲基化(methylation)、微型RNA(microRNA)及单核苷酸多型性(Single Nucleotide Polymorphism; SNP)的统计分析。

第二部分:次世代定序 (Next generation sequencing)

我们会先介绍什么是此世代定序(NGS),然后次世代定序如何应用在基因体以及转录体(Transcriptome)上的研究。最后回介绍用什么样的方法工具来分析NGS的资料。

第三部分:基因组资料的分析解读 (Analysis of genomic data)

高通量的资料可以通过一些公开的资料库来进行后续的功能性分析。我们会以两个小时来跟大家介绍这些学术界可免费使用的资料库,以及可以付费的软件,叫做Ingenuity Pathways Analysis (IPA),来进行功能路径的分析。

希望大家在看完一系列的这些介绍之后,不仅能够对这些高通量平台原理更加了解,并且能够熟悉高通量平台的资料分析和相关分析软件,期待有朝一日能亲自分析这些高通量的资料。

笔者| 蔡孟勳,博士(Mong-Hsun Tsai, Ph.D),副教授,国立台湾大学生物科技研究所;共同主持人,国立台湾大学基因体医学研究中心-基因体医学组-生物统计暨生物资讯核心实验室。

本文题图来自网络。

敬请关注下一篇文章:

专访| 基因组技术的资料分析-项目负责人 Eric Y. Chuang

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Doi:10.3978/kysj.2014.1.106

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