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PubMed高级检索:让复杂课题的检索过程简洁明了

Published at: 2015年第1卷第S1期

周旭毓
关键词:

什么时候需要用高级检索(Advanced Search)?高级检索又有什么招呢?PubMed的基本检索方便快捷,配合MeSH主题词检索,一般的检索问题都可迎刃而解。

招数一:检索构建器(Search Builder)

应用检索构建器可以很方便地实现多个字段的组合检索,提高查准率。

举个例子,要查找2000年以来中国学者在心血管领域的顶尖期刊Circulation发表了多少篇文献,需要同时满足三个条件,即命中文献的出版日期为2000年至今,作者地址字段含有China,且刊名为Circulation。下面我们看看怎样用检索构建器快速查找满足这三个条件的文献。

图1 PubMed检索构建器示例

步骤

1. 进入高级检索页面;

2. 在左侧“Builder”下方的下拉菜单中选择出版日期字段Date-Publication,按规定格式输入2000/01/01,页面上方的检索框中同步显示输入的检索词,布尔逻辑算符选择默认的“AND”;

3. 继续在第二个下拉菜单中选择地址字段Affiliation,输入China,布尔逻辑算符仍然选“AND”;

4. 再在下拉菜单中选择期刊字段Journal,输入Circulation(系统自动显示刊名中含有Circulation的所有期刊);

5. 页面上方的检索框中显示组配后的完整检索式(("2000/01/01"[Date-Publication]:"3000"[Date-Publication])ANDchina[Affiliation])AND"circulation"[Journal],点击“Edit”按钮可进一步编辑检索式;

6. 点选“Addtohistory”,将检索式及检索结果添加到下方的检索式列表中,显示命中记录为197篇(图1);

7. 点击“Search”按钮,返回检索结果显示页面,完成检索。

   Tips:在实际检索中,为提高查准率,经常会进行字段限定检索,或者多个字段的组配检索。PubMed有51个可检索字段,绝大部分字段有专用的字段标识符(Tag)。

对熟练的检索者来说,在基本检索时直接采用“检索词[字段标识符]”方式进行字段限定检索自然是最快捷的。不过对多数新手来说,要记住字段名或字段标识符并不那么容易哦。利用检索构建器Builder多字段组配检索So easy!

用检索构建器输入检索词时,点击右侧的“Showindexlist”按钮,系统显示该检索词的相关索引词及记录数,可帮助正确选词。

还有两个细节需要注意:

(1)2014年之前,PubMed每条记录的Affiliation字段只提供第一作者的地址;2014年以后,Affiliation字段包含了每篇文献所有作者的地址信息。因此,我们得到的197篇文献,实际上包含了中国学者以第一作者发表在Circulation的文献,以及2014年以来中国学者以非第一作者发表在Circulation的文献

(2)用china[A liation]限定检索中国学者发表的文献,包含了中国大陆及台湾学者的文献。

招数二:检索史(History)

检索史的重要性不言而喻。检索史完整记录了本次检索以来所有检索式的具体内容及命中结果,包括检索式序号、检索提问式(Query)、检索结果数(Itemsfound)及检索时间。检索史最多保留8小时,注册了My NCBI的小伙伴还可以随时查到最近6个月的检索史。

单击检索式序号,可执行AND、OR、NOT逻辑运算,也可以删除检索式、显示检索结果、显示实际执行的检索式或将检索式保存到My NCBI。点击“Add”按钮可以直接将某个检索式添加至检索构建器。

例如,要系统全面地查找有关“等渗和低渗对比剂与对比剂肾病发生的关系”这一课题文献,要考虑对比剂、等渗(对比剂)、低渗(对比剂)、对比剂肾病这4个概念。初步检索发现,这几个概念都有多种表达方式,考虑采用高级检索。

对比剂:contrast media OR contrast medium OR contrast agent。

对比剂肾病:contrast-induced nephropathy OR CIN OR contrastnephropathy OR contrast-induced acute kidney injury OR CI-AKI。

等渗:iso-osmolar OR isosmotic OR iodixanol OR iso-tonicOR iso-osmotic OR IOCM。

低渗:low-osmolar OR hypotonic OR iohexol OR LOCM。

图2 PubMed检索史示例

步骤

  1.  在高级检索的检索构建器中选择检索字段为title/abstract,

  2. 输入检索词

  3. 点选“Addtohistory”按钮

  4. 将检索词及检索结果添加到检索史(图2的#26)

  5. 重复上述操作

  6. 将其余检索词及检索结果都添加到检索史(图2的#27、#31、#32)

  7. 最后在检索框中直接输入用检索式序号构建的检索表达式(图2的#34)

  8. 点击“Search”按钮,完成检索,得到相关文献91篇。

   Tips:

可以看出,高级检索尤其适用于需要分步检索才能完成的较为复杂的课题,以及需要对检索策略进行反复调整的课题。

本例涉及4个概念,每个概念有多个同义词,检索词也比较复杂。尽可能查全,将每个概念限定在title/abstract字段,分步进行检索,最后再构建完整的检索表达式,这样既简洁明了,又方便对检索策略进行调整、修正。

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排版编辑:张   晗 AME Publishing Company

责任编辑:严斯瀛  江苇妍 AME Publishing Company

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