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WCLC 2017|江本元:EGFR突变非小细胞肺癌伴脑膜转移患者中来自脑脊液cfDNA的独特遗传图谱

Published at: 2015年第1卷第S1期

江本元
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编者按:第18届世界肺癌大会将于2017年10月14日-18日在日本横滨召开。广东省肺癌研究所的江本元医生将汇报“EGFR突变非小细胞肺癌伴脑膜转移患者中来自脑脊液cfDNA的独特遗传图谱”的研究成果,请看以下详细介绍。

背景:脑膜转移(LM)更常见于伴EGFR突变的非小细胞肺癌(NSCLC)患者。由于获得脑膜瘤病灶途径的限制,目前关于LM的耐药机制仍未清楚。

方法:含168个基因组的二代测序用于疑有LM的NSCLC患者的原位肿瘤、脑脊液和血浆的检测。该队列纳入30例确诊LM且有EGFR基因突变的患者,其中两名患者的CSF cfDNA和血浆以及另外两名患者的CSF沉淀物无法获得。

结果:在CSF cfDNA,CSF沉淀物和血浆中检测到驱动基因的概率分别为100% (28/28) , 85.7% (24/28) 和 75% (21/28),且92.9% (26/28)的患者在CSF cfDNA中检测到的等位基因明显高于其他两种介质。

与血浆和原位组织相比,CSF cfDNA可捕获到独特的基因图谱。CSF cfDNA可单独检测到多拷贝数变异(CNVs),TKI治疗失败后的CNVs与LM前单纯TKI治疗相比复杂很多。最常见的是MET,在44.0% (11/25)患者中检测到,其他CNVs包括ERBB2,KRAS,ALK,MYC和FGFR1。另外在67.9%(19/28)CSF cfDNA中检测到TP53杂合度缺失(LOH),比血浆检测到的高得多(2/28, 7.1%; p<0.001),并且存在一种趋势,有TP53 LOH的患者耐药突变的发生率更高(70.6% vs. 25%; p=0.036)。在28%(7/25)患者的CSF cfDNA中检测到EGFR T790M。

结论:CSF cfDNA可以提示LM独特的遗传图谱,并且应该成为伴EGFR突变NSCLC的LM患者最有代表性的检测方式。

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