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ITMIG 2017 中国之声 | 孙强玲:高通量的B型胸腺肿瘤定量蛋白质组学研究

Published at: 2015年第1卷第S1期

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编者按:由国际胸腺肿瘤协会(International Thymic Malignancy Interesting Group, ITMIG)举办的第8届年会于2017年9月21日-23日在意大利都灵Lingotto会议中心圆满召开。国际胸腺肿瘤协会是世界范围内在胸腺肿瘤临床及基础研究领域最权威及最具影响力的学术组织。本次大会由意大利Pier Luigi Filosso教授担任大会主席,吸引了来自全球20余个国家或地区超过150名胸腺领域的知名专家参会。令人欣喜的是,本次大会活跃着不少中国专家的身影,并频传喜报。中国专家共有6项发言及5份壁报展示,内容涉及到胸腺肿瘤的手术治疗、放射治疗及化学治疗、基因突变检测、蛋白定量分析、生存预后分析等多个方面。以下,是来自上海交通大学附属上海胸科医院的孙强玲医师的大会发言简介。

图1. 孙强玲医生大会发言剪影

目前基于WHO分型可将胸腺肿瘤分为A型、AB型、B型和胸腺癌,B型胸腺肿瘤占胸腺肿瘤中的绝大多数,其中又根据淋巴-上皮细胞的比例和细胞异型性程度分为B1、B2和B3型,由B1型至B3型恶性程度逐步上升,但是B型组织学亚型分析对病理医生的经验要求较高、可重复性偏低,且与临床分期相关性较强并未成为独立的预后因子,无法有效区分各种临床特点不同的亚群,对诊断治疗的指导价值有限。由此可见寻找一种可能的蛋白标记物用以协助B型胸腺肿瘤的病理分型非常有指导意义。

近些年来,质谱技术已经日新月异,成为了对蛋白质组开展相对和绝对定量的关键手段。其中一种蛋白质组学定量研究技术,即靶向蛋白质定量技术获得了越来越广泛的发展和应用,其采用复杂的数据独立性采集DIA)和平行反应监测(PRM)提供绝对可靠的可重现定量能力。DIA的特点在于对复杂样品中所有信号进行无偏向性的MS分析,母离子采用较宽的分选窗口,从而获得更高的肽段覆盖率。相较传统的同位素标记定量方法,该方法具有灵敏度高、重复性好、通量高的优点,特别适合于对大规模临床样本进行高重复性的定量检测。

孙强玲博士在此介绍了上海胸科医院方文涛教授胸腺肿瘤研究课题组与上海交大系统生物医学研究院严威教授课题组通力合作的部分研究结果。运用交大系统院质谱平台配备的Orbitrap Fusion高分辨率质谱仪,采用靶向定量蛋白质组学方法(DIA/SWATH技术)进行胸腺肿瘤WHO病理分型之间的差异蛋白表达谱分析,寻找到了一系列与肿瘤信号转导途径、细胞骨架、线粒体功能、TCR受体调控等相关的差异蛋白,并发现部分差异蛋白只在恶性程度较高的B3型胸腺肿瘤中表达,在恶性程度较低的B1型及瘤旁正常对照组织中均不表达,推测该部分蛋白将有可能为胸腺肿瘤发生及B型胸腺肿瘤中恶性转化相关的重要调控蛋白。

本项目研究将构建一个基于靶向蛋白质组学的临床组织蛋白生物标志物的研发和快速检测平台,研究内容前沿,且具有良好的医学转化前景。

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