专家访谈

专访| 基因组技术的资料分析-项目负责人 Eric Y. Chuang

Published at: 2014年第1卷第17期

关键词:

庄曜宇,Eric Y. Chuang,教授,国立台湾大学电机工程学系、国立台湾大学生医电资所、国立台湾大学生命科学系、国立台湾大学流行病学所、国立台湾大学动物所;主持人,国立台湾大学基因体医学研究中心-基因体医学组-生物统计暨生物资讯核心实验室;主任,国立台湾大学永龄生医工程中心。

1)能否请您对基因组技术的资料分析这一课程专案做一个简单的介绍?

Prof. Chuang: 高通量基因组技术的资料分析(Data analysis for high throughput genomic technology)这个课程,主要是介绍微阵列(Microarray)、次世代测序以及所涉及倒的资料库,有台湾大学基因体医学研究中心之生物资讯暨生物统计核心实验室成员制作并授课。生物医学蓬勃发展,通过传统的生物实验研究少量基因早已不能满足需求,近年来生物芯片技术已经成熟,可以同时获取大量基因资讯。但是如何从大量资料中获取有用的资讯,如何管理资料,对资料进行分析,进而应用与临床,是基因体医学的重要课题,因此希望通过本课程的学习,大家能够增进对高通量平台的了解。

2)基因组技术通常涉及哪些研究领域?针对的该课程所涉及的基因测序等内容和技术,将会脾益哪些专业人员?

Prof. Chuang: 研究领域包括各类癌症的检测等。目前已知DNA片段和基因表现的变化和肿瘤的行程密切相关。因此利用基因表现的差异可以作为癌症诊断和分类的依据。我们针对常见的癌症(如肺癌、肝癌、鼻咽癌、乳腺癌和子宫颈癌)进行研究,利用基因芯片的技术找出新的检测基因,从而发现更淮确的肿瘤鉴定方法以及可能的治疗方法。
基因组技术的资料分析课程适合生物医学相关的研究人员,如全基因组的课题研究;临床医师,如有治疗诊断需求的医生;当然医学生也会有所受益。

3). 关于基因组技术的发展前景,您有何观点?

Prof. Chuang: 通过基因资讯的检测以及资料分析,越来越多的临床意义的生物标记(biomarkers)、分子特征(Molecular signatures)、以及新的靶点(Targets)会陆续被发现。随着技术的日益成熟,基因检测以及资料分析的普遍,所需的费用亦会逐步降低,速度和效率也会越来越高,进而实现基因组为基础的医疗服务(genomic-based health care)以及个体化医疗(personalized medicine)。
随着对基因资讯越来越明了,这些基因组资讯将会知道癌症等疾病的治疗,用于发现、预防进而尽早治疗疾病,针对不同个体制定不同的治疗方案,未来对医疗产业将会产生革命性的影响。

4)您的研究团队取得的最重要成果是什么?

Prof. Chuang: 生物资讯暨生物统计核心实验室设立的目标,为支援台湾大学校内外相关研究人员生物统计咨询及实验数据分析,其次为反战生物资讯领域相关的教学研究,提供研究方法设计以及特定遗传疾病与遗传流行病学的研究服务。在研究领域,我们持续与台湾各大研究团队合作,亦有许多研究题目进行中,例如:利用微阵列基因芯片建构癌症细胞株的全方位对比系统;于乳腺癌细胞中系统性分析竞争性内生微小核糖核酸调控;以次世代定序法寻找与食道癌相关的致病基因等。本实验室亦致力于开发生物资讯演算法与工具,用以分析高通量基因资料与进行整合性资料解读。我们已开发相当多的演算法与工具,例如微小核糖核酸分析系统资料库(MIRSYSTEM, http://mirsystem.cgm.ntu.edu.tw)。并与过去三年间,将研究成果发表于60多篇国际学术期刊 SCI, SSCI, and A&HCI)以及国际研讨会的发表。此外,我们更将研究成果转译于临床治疗效果的预测,并于美国和台湾各取得一专利。

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