专题介绍

《基因组技术的资料分析》专题介绍

Published at: 2014年第1卷第17期

蔡孟勳 1
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摘要

生物科技突飞猛进,有许多高通量平台陆续被大家广泛应用在各个不同的生物或生物医学领域中。我们准备了一系列不同课程来介绍包含这个微阵列(Microarray)和次世代定序(Next Generation Sequencing; NGS)相关的议题,希望通过这些议题的介绍,让大家能更熟悉这些高通量平台的技术及原理。


基因组技术的资料分析 Data analysis for high throughput genomic technology

生物科技突飞猛进,有许多高通量平台陆续被大家广泛应用在各个不同的生物或生物医学领域中。我们准备了一系列不同课程来介绍包含这个微阵列(Microarray)和次世代定序(Next Generation Sequencing; NGS)相关的议题,希望通过这些议题的介绍,让大家能更熟悉这些高通量平台的技术及原理。

课程包括以下三个部分,

第一个部分:微阵列芯片(Microarray)

从介绍什么是微阵列芯片开始,接着介绍微阵列芯片的资料如何进行基因表现差异分析,以及利用微阵列芯片来进行对甲基化(methylation)、微型RNA(microRNA)及单核苷酸多型性(Single Nucleotide Polymorphism; SNP)的统计分析。

第二部分:次世代定序 (Next generation sequencing)

我们会先介绍什么是此世代定序(NGS),然后次世代定序如何应用在基因体以及转录体(Transcriptome)上的研究。最后回介绍用什么样的方法工具来分析NGS的资料。

第三部分:基因组资料的分析解读 (Analysis of genomic data)

高通量的资料可以通过一些公开的资料库来进行后续的功能性分析。我们会以两个小时来跟大家介绍这些学术界可免费使用的资料库,以及可以付费的软件,叫做Ingenuity Pathways Analysis (IPA),来进行功能路径的分析。

希望大家在看完一些列的这些介绍之后,不仅能够对这些高通量平台原理更加了解,并且能够熟悉高通量平台的资料分析和相关分析软件,期待有朝一日能亲自分析这些高通量的资料。

蔡孟勳 博士(Mong-Hsun Tsai, Ph.D)

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