微信直播

AME循证杂谈012|如何用图形完美展示临床研究中亚组分析的结果

Published at: 2015年第1卷第S1期

周支瑞
关键词:

写在前面

由于笔者高考数学没考好,从此对于数字的东西再也没有信心,不过也因此因祸得福,笔者更执着于用图形来表达临床研究或者基础研究的结果。其实人们大抵如此,较之于冗长无聊的文字和数字,人类的大脑对于图形会留下更深刻的印象,正所谓“一图胜万言”。笔者今天将要讨论的主题,曾经被很多人问过,所以我感觉可能有很多人需要get这个新技能,独乐乐不如众乐乐,今日笔者与大家分享这一实用的新技能。

下面这幅图来自于无数人梦寐以求灌水的杂志~传说中牛气哄哄的新英格兰医学杂志的某篇随机对照试验的报告。作者们为了显示他们工作做得是多么细致入微,按照各种因素做了一系列的亚组分析的结果。虽然笔者对这些可有可无的亚组分析结果的价值嗤之以鼻,但是不得不承认这幅图画的很好,清晰明了。下面我们就以这幅图的例子来演示下怎么复制一幅一样的图出来,让我们的临床研究论文也显得高大上。图一为我从文章中截取的原图:

 

图一

第一步,还原图中的数据,如果您已经有数据,这一步完全可省去。因为我要举实例把这个问题说明白,只能把数字一个一个往excel表格里敲,这是一件非常痛苦的事情!最终的数据录入如下(可能会有笔误,夜太深,笔者眼神可能不好使),事实上能否做出符合要求的图,秘诀全在整理数据上。核心要点如下:把上图中的分组因素统一列为“group”变量;把具体的分组因素列为”subgroup”变量;实验组与对照组的中位生存时间分别列为“A”、“P”变量;HR及可信区间分三列分别列出。如图二所示:


图二

 

第二步,把数据粘贴入stata数据编辑器,从Excel粘贴数据的具体方式可参考循证杂谈10。最终录入Stata的数据如图三所示:


图三

第三步,在stata命令窗口输入命令如下:

metan hr ll ul, label(namevar=subgroup) by(group) fixed effect(Hazard Ratio) null(1) nosubgroup nowt nooverall rcols(A P) xlabel(0.1,1,1.3) force

尽管我们采用了metan的命令,事实上我们并不需要任何合并,只是展示数据,所以我们添加了选择项“nosubgroup nowt nooverall”,令其不总的合并,也不亚组合并,也不计算权重。“effect(Hazard Ratio)”令其在森林图的右上角显示Hazard Ratio字样。“ null(1)”令无效线从横轴的1经过。“rcols(A P)”令在森林图的右侧显示实验组与对照组的中位生存时间。“ xlabel(0.1,1,1.3) force”修饰横轴的刻度并令森林图在0.1~1.3范围内显示,超出的部分用箭头表示。最终可得图形如下,下面这幅图(图四)与原文的图形已经很相似,但是还需要进一步的美化。

 


图四

第四步,导出eps格式的森林图,在Adobe Illustrator软件中进行美化。美化过程稍显繁琐,如果凑合使用,那么上面的图形也可以基本满足要求,如果是处女座的,也可以参考以下图形美化的过程。当然这个美化的过程需要对Adobe Illustrator有一定的了解,基本都是一些细节操作,比如在按照原图,在图上添加一些必要的文字,对图中的一些变量名进行合理的修改,让其更美观,调整字体,把亚组名称用加粗突出显示等。美化之后的图形如下(图五):


图五

至此,可以获得一张直接用于投稿的展示亚组分析结果的图形,美观,简洁,清晰、明了。以上雕虫小技,希望对大家有用。

作者| 周支瑞,复旦大学肿瘤医院放疗科在读博士。AME学术沙龙委员,喜读书,广交友。业余时间担任丁香园循证医学讨论版版主,自学临床流行病学与循证医学五年余。主要研究方向:恶性肿瘤放射治疗与放射生物学研究、循证医学与Meta分析方法学研究。目前以第一作者及共同作者发表SCI论文十余篇,参编学术著作两部。

本文题图来自网络。本文由AME科研时间(微信公众号:amegroups)首发,转载请注明出处。

AME循证杂谈专栏

01 走出循证医学的八大误区

02 临床医生该如何高效的检索?

03 系统评价哪家强?

04 正确认识系统评价/meta分析在医学科研和临床实践中的作用

05 何为一篇好文章?

06 随机对照试验中那些真假难辨的亚组分析

07 随机对照试验的批判性阅读

08 系统评价的idea从哪里来?

09 顶级医学杂志发表什么样的meta分析?

10 如何画出人生第一张森林图?

11 亚组分析在meta分析中的应用

12 如何用图形完美展示临床研究中亚组分析的结果

 

查看往期专栏文章方式:

进入科研时间网站首页,搜索关键词 循证杂谈 即可。

Doi:10.3978/kysj.2014.1.589

comments powered by Disqus

附件